長(zhǎng)江水環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室依托于同濟(jì)大學(xué)，涵蓋環(huán)境科學(xué)、環(huán)境工程、市政工程、海洋科學(xué)、應(yīng)用化學(xué)、水利工程等學(xué)科。2003年11月，教育部批復(fù)同意組建長(zhǎng)江水環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。2004年6月，實(shí)驗(yàn)室通過(guò)教育部科技司組織的專家論證，開(kāi)始建設(shè)。2006年7月，實(shí)驗(yàn)室通過(guò)教育部驗(yàn)收，并正式成立。2009年、2015年和2020年，分別通過(guò)了教育部的評(píng)估。

實(shí)驗(yàn)室以“共抓大保護(hù)”推動(dòng)長(zhǎng)江經(jīng)濟(jì)帶一體化發(fā)展的國(guó)家戰(zhàn)略需求引領(lǐng)，緊緊圍繞長(zhǎng)江流域水環(huán)境重大科學(xué)技術(shù)問(wèn)題和國(guó)際學(xué)科前沿，立足長(zhǎng)江下游和長(zhǎng)三角地區(qū)，面向全流域，以“污染防治-水環(huán)境質(zhì)量改善-水安全保障”為主線，構(gòu)建“基礎(chǔ)研究-技術(shù)研發(fā)-應(yīng)用示范”的知識(shí)創(chuàng)新鏈，在凝聚國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀人才、培養(yǎng)創(chuàng)新人才、國(guó)際合作與交流和學(xué)科發(fā)展等方面，實(shí)現(xiàn)示范和引領(lǐng)作用，為長(zhǎng)江大保護(hù)國(guó)家戰(zhàn)略和國(guó)際流域水環(huán)境學(xué)術(shù)研究做出重要貢獻(xiàn)。

實(shí)驗(yàn)室充分發(fā)揮同濟(jì)大學(xué)多學(xué)科交叉的優(yōu)勢(shì)與特點(diǎn)，錨定實(shí)驗(yàn)室定位和目標(biāo)，圍繞水環(huán)境演化和生態(tài)響應(yīng)、水資源利用與水質(zhì)安全、污染防治與生態(tài)修復(fù)、流域水環(huán)境管理四個(gè)研究方向，在凝聚隊(duì)伍、科技創(chuàng)新、國(guó)內(nèi)外合作和人才培養(yǎng)等方面形成特色和優(yōu)勢(shì)，具有重要的國(guó)內(nèi)外影響力。

近五年來(lái)，主持國(guó)家“水體 污染控制與治理”科技重大專項(xiàng)、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家基金等一批國(guó)家項(xiàng)目， 在化學(xué)品污染脅迫與生態(tài)效應(yīng)、深度去除新方法與原理等方面取得原創(chuàng)性成果；在城鎮(zhèn)污水污泥高效處理、河流污染治理與管理、飲用水深度凈化等關(guān)鍵技術(shù)取得突破與創(chuàng)新，廣泛應(yīng)用于長(zhǎng)江中下游水污染防治和飲用水安全保障工程，取得了顯著的社會(huì)經(jīng)濟(jì)和環(huán)境效應(yīng)，并為標(biāo)準(zhǔn)制定、政府決策提供強(qiáng)有力的支撐。

圍繞長(zhǎng)江大保護(hù)戰(zhàn)略需求，著力開(kāi)展“1船（科考船）、1庫(kù)（環(huán)境樣品庫(kù)）、和2基地（崇明和宜賓）”建設(shè)，與長(zhǎng)江生態(tài)環(huán)保集團(tuán)等共建戰(zhàn)略合作平臺(tái)，深入開(kāi)展安徽省馬鞍山市長(zhǎng)江生態(tài)環(huán)境保護(hù)修復(fù)駐點(diǎn)跟蹤研究。

實(shí)驗(yàn)室與瑞典、加拿大、德國(guó)開(kāi) 展實(shí)質(zhì)性合作，組建國(guó)際化研究團(tuán)隊(duì)，合作成立“中瑞環(huán)境與健康”、“中加環(huán)境 與可持續(xù)發(fā)展”和“中德清潔水”等實(shí)驗(yàn)室或平臺(tái)，承擔(dān)國(guó)際合作科研項(xiàng)目，組織召開(kāi)一批國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議，出版研究專著和長(zhǎng)江流域水環(huán)境研究論文專刊，聯(lián)合培養(yǎng)研究生，成為高層次創(chuàng)新人才培養(yǎng)基地，特色鮮明的國(guó)際合作與交流重要窗口。

秉承實(shí)驗(yàn)室優(yōu)勢(shì)，深化沿江高校合作，“長(zhǎng)江水環(huán)境研究暨高校協(xié)作組學(xué)術(shù)會(huì)議”已連續(xù)舉辦16年，成為重要影響的學(xué)術(shù)交流平臺(tái)，促進(jìn)了沿江高校相關(guān)學(xué)科與企業(yè)人才培養(yǎng)協(xié)同發(fā)展。